西北农林科技大学植物保护学院可以追溯到国立西北农林专科学校1936年组建的植物病虫害教学组。1936年开始招收本科生，1960年开始招收研究生。

学院现设植物病理学系、昆虫学系、农药学系3个教学系和植物病理学研究所，昆虫学研究所、农药学研究所以及一个植保技术推广服务中心；有植物保护、制药工程2个本科专业；有植物保护一级学科博士点1个，植物保护博士后流动站1个，有植物病理学、农业昆虫与害虫防治、农药学、有害生物治理生态工程、植保资源利用等5个二级学科博士、硕士学位授权点；植物病理学是国家重点学科，农业昆虫与害虫防治是国家重点（培育）学科，农药学是陕西省重点学科。

学院有植保资源与害虫治理教育部重点实验室、农业部农作物病虫害综合治理与系统学重点开放实验室、陕西省植物源农药研究与开发重点实验室、农业部农业有害生物无公害控制技术创新中心、陕西省生物农药工程技术研究中心、农业部太白小麦条锈病菌重点野外科学观测实验站、国家“985”工程“农业有害生物治理与生物源农药创新”科技创新平台及教育部、国家外专局“创新引智基地”、学校应用昆虫学重点实验室等12个省部以及学校科技创新科研平台；有一个中试基地及11个校外教学实践基地；目前亚洲最大的昆虫博物馆为学院创办，主办《昆虫分类学报》；收藏昆虫标本120多万号，植物真菌病害标本5万多号；中国昆虫学会蝴蝶分会，中国植物病理学会植物抗病育种专业委员会、陕西省昆虫学会、陕西省植物病理学会、陕西省植物保护学会均挂靠在学院。